Els òrgans de govern de la FEFIC (articles 14-28 dels Estatuts) són l'Assemblea General, òrgan sobirà constituït per tots els membres amb dret de veu i vot i que es reuneix com a mínim dues vegades l'any, i la Junta Directiva, escollida per períodes quadriennals, encarregada de governar i administrar la federació.
La Junta Directiva de la FEFIC està composada per